主人公·焰莲回到曾经住过的街道·神之原，感应感染到了违和感。他确实应该在这条街道住过，却对那时的工作没有记忆。此时，莲的智妙手机俄然被安装了从没见过的游戏，其名为《怪物弹珠》。他带着从手机中飞向现实世界的怪物，在街道中睁开了战斗！经由战斗，莲注重到了在自己体内沉睡的谜之记忆的正体，以及，怪物弹珠事实是何物。与握有钥匙的水泽葵、影月明、若叶皆实一路，现在的莲正迈出通往谜团的一步，对于前方沉睡着无法想象的秘闻一事，仍然全无所闻。